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酵母單雜交技術(shù)

酵母單雜交技術(shù)是一種研究蛋白質(zhì)和特定DNA序列相互作用的技術(shù)方法,主要包括四個(gè)流程即:一、篩選含有報(bào)告基因的酵母單細(xì)胞株;二、構(gòu)建表達(dá)文庫(kù);三、重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化至酵母細(xì)胞;四、陽(yáng)性克隆菌株的篩選。

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實(shí)驗(yàn)介紹

【技術(shù)原理】

酵母單雜交(yeast one hybrid)技術(shù)是體外分析DNA與細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)相互作用的一種方法,通過(guò)對(duì)酵母細(xì)胞內(nèi)報(bào)告基因表達(dá)狀況的分析,來(lái)鑒別DNA結(jié)合位點(diǎn)并發(fā)現(xiàn)潛在的結(jié)合蛋白基因,或?qū)NA結(jié)合位點(diǎn)進(jìn)行分析。

其基本原理為:真核生物基因的轉(zhuǎn)錄起始需轉(zhuǎn)錄因子參與,轉(zhuǎn)錄因子通常由一個(gè)DNA特異性結(jié)合功能域和一個(gè)或多個(gè)其他調(diào)控蛋白相互作用的激活功能域組成,即DNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域(DNA—bindingdomain,BD)和轉(zhuǎn)錄激活結(jié)構(gòu)域(activationdomain,AD)??蓸?gòu)建各種基因與AD的融合表達(dá)載體,在酵母中表達(dá)為融合蛋白時(shí),根據(jù)報(bào)告基因的表達(dá)情況,便能篩選出與靶元件有特異結(jié)合區(qū)域的蛋白。理論上,在單雜交檢測(cè)中,任何靶元件都可被用于篩選一種與之有特異結(jié)合區(qū)域的蛋白。

運(yùn)用此技術(shù),能篩選到與DNA結(jié)合的蛋白質(zhì),并可直接從基因文庫(kù)中得到編碼該蛋白質(zhì)的核苷酸序列,而無(wú)需復(fù)雜的蛋白質(zhì)分離純化操作,故在蛋白研究中,具有一定的優(yōu)勢(shì);而且,酵母屬真核細(xì)胞,通過(guò)酵母系統(tǒng)得到的結(jié)果比其他體外技術(shù)獲得的結(jié)果更能體現(xiàn)真核細(xì)胞內(nèi)基因表達(dá)調(diào)控的真實(shí)情況。


【實(shí)驗(yàn)流程】

送檢與交付標(biāo)準(zhǔn)

樣品類型樣品需求保存條件運(yùn)輸條件備注
動(dòng)物組織單個(gè)樣品>0.1g,2mlEP管或凍存管裝,不要過(guò)量;樣本應(yīng)盡量新鮮,如不能立即提取蛋白或核酸,應(yīng)液氮速凍后凍存于-80℃或更低,凍存樣本避免反復(fù)凍融以致降解-80℃干冰所有樣本均須有唯一標(biāo)記,且標(biāo)記清晰可識(shí)
種子樣本去殼新鮮或保存于液氮中的的種子樣本,單個(gè)樣品>0.2g。-80℃干冰
貼壁/懸浮細(xì)胞

1. 總RNA或蛋白:106cell/指標(biāo)、漿/核RNA或蛋白:107cell/指標(biāo)、線粒體RNA或蛋白:2*107     cell/指標(biāo),樣本盡量新鮮,細(xì)胞收取后直接加Trizol(QPCR檢測(cè))或直接凍存于-80℃       

2. 若細(xì)胞處理(加藥、轉(zhuǎn)染、感染)后狀態(tài)差應(yīng)酌情加大收樣量

-80℃干冰
全血/血清樣品用抗凝管保存的外周血 5~10ml,骨髓 1~3ml; -80℃保存不超半周的白細(xì)胞勻漿>400μl,每 400μl 加入 400μl Trizol。-80℃干冰
石蠟包埋樣品由標(biāo)準(zhǔn)的石蠟包埋盒包埋的石蠟塊,有效厚度大于 0.1cm; 新鮮的 FFPE 組織切片,每片厚度不超過(guò) 10μm,2~8 張,表面積不超過(guò) 250mm2。-20℃冰袋
抗體

1. 按樣本種屬提供滿足相應(yīng)實(shí)驗(yàn)要求的抗體;

2. 按抗體說(shuō)明書要求寄送,盡量避免分裝;如分裝,確保量足夠進(jìn)行實(shí)驗(yàn),并提供抗體說(shuō)明書。

3.保存抗體的抗體管上應(yīng)有能夠識(shí)別此抗體的標(biāo)記,抗體的量應(yīng)大于實(shí)驗(yàn)所需的量。

-20℃冰袋
引物干粉,≥1OD,如進(jìn)行預(yù)實(shí)驗(yàn),每個(gè)基因至少提供兩對(duì)引物, 附帶公司引物合成單。-20℃冰袋或常溫




細(xì)胞交付標(biāo)準(zhǔn).jpg

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