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shRNA載體構(gòu)建

首先設(shè)計(jì)根據(jù)需求設(shè)計(jì)shRNA引物一套,完成引物退火。將載體進(jìn)行雙酶切反應(yīng),雙酶切后割膠回收。將shRNA和雙酶切回收后的載體,使用試劑盒進(jìn)行重組成環(huán)狀片段,轉(zhuǎn)入制備好的細(xì)菌感受態(tài)細(xì)胞,對(duì)長出的單克隆菌落送測序公司進(jìn)行測序鑒定,比對(duì)正確的克隆即為構(gòu)建成功的shRNA表達(dá)載體。

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實(shí)驗(yàn)介紹

【技術(shù)原理】

首先設(shè)計(jì)根據(jù)需求設(shè)計(jì)shRNA引物一套,完成引物退火。將載體進(jìn)行雙酶切反應(yīng),雙酶切后割膠回收。將shRNA和雙酶切回收后的載體,使用試劑盒進(jìn)行重組成環(huán)狀片段,轉(zhuǎn)入制備好的細(xì)菌感受態(tài)細(xì)胞,對(duì)長出的單克隆菌落送測序公司進(jìn)行測序鑒定,比對(duì)正確的克隆即為構(gòu)建成功的shRNA表達(dá)載體。

shRNA的靶點(diǎn)選擇決定著對(duì)靶向基因的表達(dá)敲低效果,通常涉及3-4個(gè)shRNA靶點(diǎn)同時(shí)進(jìn)行實(shí)驗(yàn),根據(jù)后續(xù)檢測結(jié)果確定最佳靶點(diǎn)后,安排后續(xù)實(shí)驗(yàn)。


【實(shí)驗(yàn)流程】


shRNA載體構(gòu)建流程.png

案例展示

shRNA載體構(gòu)建_副本.jpg

送檢與交付標(biāo)準(zhǔn)

樣品類型樣品需求保存條件運(yùn)輸條件備注
動(dòng)物組織單個(gè)樣品>0.1g,2mlEP管或凍存管裝,不要過量;樣本應(yīng)盡量新鮮,如不能立即提取蛋白或核酸,應(yīng)液氮速凍后凍存于-80℃或更低,凍存樣本避免反復(fù)凍融以致降解-80℃干冰所有樣本均須有唯一標(biāo)記,且標(biāo)記清晰可識(shí)
種子樣本去殼新鮮或保存于液氮中的的種子樣本,單個(gè)樣品>0.2g。-80℃干冰
貼壁/懸浮細(xì)胞

1. 總RNA或蛋白:106cell/指標(biāo)、漿/核RNA或蛋白:107cell/指標(biāo)、線粒體RNA或蛋白:2*107     cell/指標(biāo),樣本盡量新鮮,細(xì)胞收取后直接加Trizol(QPCR檢測)或直接凍存于-80℃       

2. 若細(xì)胞處理(加藥、轉(zhuǎn)染、感染)后狀態(tài)差應(yīng)酌情加大收樣量

-80℃干冰
全血/血清樣品用抗凝管保存的外周血 5~10ml,骨髓 1~3ml; -80℃保存不超半周的白細(xì)胞勻漿>400μl,每 400μl 加入 400μl Trizol。-80℃干冰
石蠟包埋樣品由標(biāo)準(zhǔn)的石蠟包埋盒包埋的石蠟塊,有效厚度大于 0.1cm; 新鮮的 FFPE 組織切片,每片厚度不超過 10μm,2~8 張,表面積不超過 250mm2。-20℃冰袋
抗體

1. 按樣本種屬提供滿足相應(yīng)實(shí)驗(yàn)要求的抗體;

2. 按抗體說明書要求寄送,盡量避免分裝;如分裝,確保量足夠進(jìn)行實(shí)驗(yàn),并提供抗體說明書。

3.保存抗體的抗體管上應(yīng)有能夠識(shí)別此抗體的標(biāo)記,抗體的量應(yīng)大于實(shí)驗(yàn)所需的量。

-20℃冰袋
引物干粉,≥1OD,如進(jìn)行預(yù)實(shí)驗(yàn),每個(gè)基因至少提供兩對(duì)引物, 附帶公司引物合成單。-20℃冰袋或常溫




細(xì)胞交付標(biāo)準(zhǔn).jpg

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