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GST pulldown

GST pull-down實(shí)驗(yàn)是一個(gè)行之有效的驗(yàn)證酵母雙雜交系統(tǒng)的體外試驗(yàn)技術(shù),近年來(lái)越來(lái)越受到廣大學(xué)者的青睞。

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實(shí)驗(yàn)介紹

【技術(shù)原理】

GST pulldown實(shí)驗(yàn)是一個(gè)有效驗(yàn)證酵母雙雜交系統(tǒng)的體外試驗(yàn)技術(shù)。

基本原理:將靶蛋白-GST 融合蛋白親和固化在谷胱甘肽親和樹(shù)脂上,作為與目的蛋白親和的支撐物,充當(dāng)一種“誘餌蛋白”,目的蛋白溶液過(guò)柱,可從中捕獲與之相互作用的“捕獲蛋白”(目的蛋白),洗脫結(jié)合物通過(guò) SDS-PAGE 電泳分離,最后經(jīng)western blot或質(zhì)譜分析,從而證實(shí)兩種蛋白間的相互作用;

        1. 確定某一個(gè)蛋白質(zhì)與另一個(gè)蛋白質(zhì)的直接作用關(guān)系。

        2. 篩選某一個(gè)蛋白質(zhì)直接結(jié)合的蛋白質(zhì)族群。

        3. 驗(yàn)證酵母雙雜交系統(tǒng)結(jié)果的有效性。

        
【技術(shù)原理圖】



案例展示

優(yōu)勢(shì)與不足

優(yōu)勢(shì):

1. 區(qū)別于CoIP,GST pull down技術(shù)可以明確兩個(gè)蛋白質(zhì)之間是否直接作用。

2. 可用于篩選與目的蛋白質(zhì)直接結(jié)合的蛋白質(zhì)族群。

3. 可聯(lián)合酵母雙雜交系統(tǒng)綜合評(píng)估蛋白質(zhì)之間的相互作用關(guān)系,是一個(gè)有效的驗(yàn)證酵母雙雜交系統(tǒng)的體外試驗(yàn)技術(shù)。

不足:

1. 體外表達(dá)的重組蛋白,無(wú)法完全模擬特定生理狀態(tài)下的蛋白質(zhì)活性及結(jié)合情況。


送檢與交付標(biāo)準(zhǔn)

樣品類(lèi)型樣品需求保存條件運(yùn)輸條件備注
動(dòng)物組織單個(gè)樣品>0.1g,2mlEP管或凍存管裝,不要過(guò)量;樣本應(yīng)盡量新鮮,如不能立即提取蛋白或核酸,應(yīng)液氮速凍后凍存于-80℃或更低,凍存樣本避免反復(fù)凍融以致降解-80℃干冰所有樣本均須有唯一標(biāo)記,且標(biāo)記清晰可識(shí)
種子樣本去殼新鮮或保存于液氮中的的種子樣本,單個(gè)樣品>0.2g。-80℃干冰
貼壁/懸浮細(xì)胞

1. 總RNA或蛋白:106cell/指標(biāo)、漿/核RNA或蛋白:107cell/指標(biāo)、線粒體RNA或蛋白:2*107     cell/指標(biāo),樣本盡量新鮮,細(xì)胞收取后直接加Trizol(QPCR檢測(cè))或直接凍存于-80℃       

2. 若細(xì)胞處理(加藥、轉(zhuǎn)染、感染)后狀態(tài)差應(yīng)酌情加大收樣量

-80℃干冰
全血/血清樣品用抗凝管保存的外周血 5~10ml,骨髓 1~3ml; -80℃保存不超半周的白細(xì)胞勻漿>400μl,每 400μl 加入 400μl Trizol。-80℃干冰
石蠟包埋樣品由標(biāo)準(zhǔn)的石蠟包埋盒包埋的石蠟塊,有效厚度大于 0.1cm; 新鮮的 FFPE 組織切片,每片厚度不超過(guò) 10μm,2~8 張,表面積不超過(guò) 250mm2。-20℃冰袋
抗體

1. 按樣本種屬提供滿足相應(yīng)實(shí)驗(yàn)要求的抗體;

2. 按抗體說(shuō)明書(shū)要求寄送,盡量避免分裝;如分裝,確保量足夠進(jìn)行實(shí)驗(yàn),并提供抗體說(shuō)明書(shū)。

3.保存抗體的抗體管上應(yīng)有能夠識(shí)別此抗體的標(biāo)記,抗體的量應(yīng)大于實(shí)驗(yàn)所需的量。

-20℃冰袋
引物干粉,≥1OD,如進(jìn)行預(yù)實(shí)驗(yàn),每個(gè)基因至少提供兩對(duì)引物, 附帶公司引物合成單。-20℃冰袋或常溫




細(xì)胞交付標(biāo)準(zhǔn).jpg

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