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Northern Blot印跡雜交?實驗詳細(xì)操作步驟

2022-04-21 22:23:24

來源/作者:普拉特澤-生物醫(yī)學(xué)整體課題外包平臺

  Northern Blot印跡雜交實驗操作步驟由普拉特澤生物總結(jié)分享,Northern Blot是一種將RNA從瓊脂糖凝膠中轉(zhuǎn)印到硝酸纖維素膜上的方法,普拉特澤生物分子檢測平臺專業(yè)承接Northern Blot實驗外包代做服務(wù),實驗真,周期短,值得信賴。

圖片來源《Feedback inhibition of L1 and alu retrotransposition through altered double strand break repair kinetics》


  Northern Blot實驗詳細(xì)操作步驟:

      1、總RNA提取。

      2、變性膠的制備:取瓊脂糖0.2g,加入DEPC H2O12.4 ml,加熱融化,于保溫狀態(tài)下加入5×甲醛凝膠電泳緩沖液4.0ml、37%甲醛3.6ml,混勻、制膠。待膠凝固后,置1×甲醛凝膠電泳緩沖液中預(yù)電泳5min。

      3、樣品制備:取總RNA4.5μl(約20-30μg) ,加入5×甲醛凝膠電泳緩沖液 4.0μl、37%甲醛3.6μl、甲酰胺10μl,65℃溫育15min、冰浴5min。加入EB(1μg/μl)1μl、上樣緩沖液2μl。

      4、電泳:上樣,50V電泳(電泳時間約2hr左右)。電泳結(jié)束后將膠塊置紫外燈下,觀察RNA的完整性,記錄18S、28S條帶的位置(離加樣孔的距離)。

      5、將RNA從變性膠轉(zhuǎn)移到硝酸纖維素膜或尼龍膜:

      ① 按膠塊大小剪取膜一張,用DEPC水中浸濕后,置于20×SSC中浸泡1hr。剪去膜一角。將膠塊切去一角,并在20×SSC浸泡15min×2次。

      ② 用長和寬均大于凝膠的一塊有機(jī)玻璃板作為平臺,將其放入大的干烤皿上,上面放一張Whatman 3MM濾紙,倒入20×SSC使液面略低于平臺表面,當(dāng)平臺上方的3MM濾紙濕透后,用玻棒趕出所有氣泡。

      ③ 將凝膠翻轉(zhuǎn)后置于平臺上濕潤的3MM濾紙中央,3MM濾紙和凝膠之間不能滯留氣泡。

      ④ 用Parafilm膜圍繞凝膠四周,以此作為屏障,阻止液體自液池直接流至膠上方的紙巾。

      ⑤ 在凝膠上方放置預(yù)先已浸濕的尼龍膜,排除膜與凝膠之間的氣泡。

      ⑥ 將二張已濕潤的、與凝膠大小相同的3MM濾紙置于膜的上方,排除濾紙與濾膜之間的氣泡。

      ⑦將一疊(5-8cm厚)略小于3MM濾紙的紙巾置于3MM濾紙的上方,并在紙巾上方放一塊玻璃,然后用一個重約500克的重物壓在玻璃板上。其目的是建立液體自液池經(jīng)凝膠向膜上行流路,以洗脫凝膠中的RNA并使 其聚集在膜上。


      6、使上述RNA轉(zhuǎn)移持續(xù)進(jìn)行15hr左右。在轉(zhuǎn)膜過程中,當(dāng)紙巾浸濕后,應(yīng)更換新的紙巾。

      7、轉(zhuǎn)移結(jié)束后,揭去凝膠上方的紙巾和3MM濾紙。將膜在6×SSC中浸泡5 min,以去除膜上殘留的凝膠。

      8、將凝膠置紫外燈下,觀察膠塊上有無殘留的RNA。

      9、膜置80℃,真空干烤1-2hr??靖珊蟮哪び盟芰洗芊?,4℃保存?zhèn)溆谩?/span>

      10、探針標(biāo)記(Prime-a-Gene Labeling System, Promega公司):

      ① 取模板DNA 25ng于0.5ml離心管中,95-100℃變性5min,冰浴5min。

      ② dNTPmix的制備: 取dGTP 1μl、dATP 1μl、dTTP 1μl混勻。

      ③ 將下列反應(yīng)成份混合,加入上述微量離心管中:

      dNTPmix 2.0μl

      BSA(10mg/ml ) 2.0μl

      5×buffer 10.0μl

      Klenow 酶(5u/μl) 1.0μl

      α-32P-dCTP 5.0μl
      加入適量dd H2O使反應(yīng)總體積達(dá)50μl,輕輕混勻。室溫下反應(yīng)1hr。

      11、預(yù)雜交:將膜的反面緊貼雜交瓶,加入預(yù)雜交液5ml,42℃預(yù)雜交3hr。

      12、雜交:將變性的探針(95-100℃變性5min,冰浴5min)加入到預(yù)雜交液中,42℃雜交16hr。

      13、洗膜:

      ① 倒去雜交液。

      ② 2×SSC/0.1%SDS室溫洗15min。

      ③ 0.2×SSC/0.1%SDS,55℃洗15min×2次。

      14、壓片:將膜用ddH2O漂洗片刻,用濾紙吸去膜上水份。用薄型塑料紙將膜包好,置于暗盒中,在暗室中壓上X光片。暗盒置-70℃放射自顯影3~7天左右

      好啦,Northern Blot實驗的詳細(xì)操作步驟我們就全部講完啦!還有沒看懂或者有關(guān)于Northern Blot實驗操作細(xì)節(jié)要補(bǔ)充的同學(xué)歡迎留言分享給大家哦!

  

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