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GST pulldown實驗原理與介紹【pull down外包】

2022-09-28 15:32:38

來源/作者:普拉特澤-生物醫(yī)學整體課題外包平臺

        蛋白功能已成為當下研究的熱點之一,蛋白間相互作用在細胞的生命活動中起著關(guān)鍵作用。相互作用的蛋白之間通過形成復雜的功能性復合體,參與細胞內(nèi)一系列的信號級聯(lián)反應(yīng),從而調(diào)控細胞及個體的生命活動。研究蛋白間相互作用的常用方法有:酵母雙雜、雙分子熒光互補、免疫共沉淀和GST pull-down等。那么今天普拉特澤生物來詳細講的——GST pull-down實驗

        GST pull-down實驗---GST:谷胱甘肽巰基轉(zhuǎn)移酶(Glutathione S-transferase)是一個行之有效的驗證酵母雙雜交系統(tǒng)的體外試驗技術(shù),近年來越來越受到廣大學者的青睞。其基本原理是將靶蛋白-GST(Glutathione-S-transferase谷胱苷肽巰基轉(zhuǎn)移酶)融合蛋白親和固化在谷胱甘肽標記的磁珠上,作為與目的蛋白親和的支撐物,充當一種“誘餌蛋白”,目的蛋白溶液與之孵育,可從中捕獲與之相互作用的“捕獲蛋白”(目的蛋白),洗脫結(jié)合物后通過SDS-PAGE電泳分析,從而證實兩種蛋白間的相互作用或篩選相應(yīng)的目的蛋白,“誘餌蛋白”和“捕獲蛋白”均可通過細胞裂解物、純化的蛋白、表達系統(tǒng)以及體外轉(zhuǎn)錄翻譯系統(tǒng)等方法獲得。此方法簡單易行,操作方便?!ST:谷胱甘肽巰基轉(zhuǎn)移酶(Glutathione S-transferase)

        GST pull-down技術(shù)主要在體外驗證兩種蛋白之間是否存在直接的相互作用,其用途主要有兩個方面:一是證實兩種已知蛋白之間可能存在的相互作用;二是用于尋找能與已知的蛋白發(fā)生相互作用的未知蛋白。詳細作用有:

        1. 確定某一個蛋白質(zhì)與另一個蛋白質(zhì)的直接作用關(guān)系。

        2. 篩選某一個蛋白質(zhì)直接結(jié)合的蛋白質(zhì)族群。

        3. 驗證酵母雙雜交系統(tǒng)結(jié)果的有效性。

        GST pulldown檢測的優(yōu)勢與不足

        優(yōu)勢:

        1. 區(qū)別于CoIP,GST pull down技術(shù)可以明確兩個蛋白質(zhì)之間是否直接作用。

        2. 可用于篩選與目的蛋白質(zhì)直接結(jié)合的蛋白質(zhì)族群。

        3. 可聯(lián)合酵母雙雜交系統(tǒng)綜合評估蛋白質(zhì)之間的相互作用關(guān)系,是一個有效的驗證酵母雙雜交系統(tǒng)的體外試驗技術(shù)。

        不足:體外表達的重組蛋白,無法完全模擬特定生理狀態(tài)下的蛋白質(zhì)活性及結(jié)合情況。

        通常我們研究蛋白互作的數(shù)據(jù)庫有很多,這里給大家推薦五個,可以自行選擇使用:

        1. MINT

        Licata L, Briganti L, Peluso D, et al. MINT, the molecular interaction database: 2012 update[J]. Nucleic acids research, 2011, 40(D1): D857-D861.

        網(wǎng)址:https://mint.bio.uniroma2.it

        2. STRING

        Szklarczyk D, Morris J H, Cook H, et al. The STRING database in 2017: quality-controlled proteinprotein association networks, made broadly accessible[J]. Nucleic acids research, 2017, 45(D1): D362-D368.

        網(wǎng)址:http://string-db.org/

        3. HPRO

        Prasad, T. S. K. et al. (2009) Human Protein Reference Database - 2009 Update. Nucleic Acids Research. 37, D767-72.

        網(wǎng)址:http://www.hprd.org/

        4. BioGRID

        Chatraryamontri A, Oughtred R, BoucherL, et al. The BioGRID interaction database: 2017 update[J]. Nucleic acids research, 2017, 45(D1): D369-D379.

        網(wǎng)址:http://thebiogrid.org/

        5. DIPOS

        Database of Interacting Proteins in Oryza SativaSapkota A, Liu X, Zhao X M, et al. DIPOS: database of interacting proteins in Oryza sativa[J]. Molecular BioSystems, 2011, 7(9): 2615-2621.

        網(wǎng)址:http://comp-sysbio.org/dipos/?id=5

        好啦,那關(guān)于GST pull down實驗我們就簡單介紹到這里啦!下期跟大家分享GST pull down實驗的操作步驟,如果您正在準備操作這個實驗或有GST pull down實驗外包的需求,歡迎隨時留言與普拉特澤分子檢測平臺的技術(shù)進行技術(shù)交流溝通!



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