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如何看質(zhì)粒圖譜?

2021-06-11 11:33:44

來源/作者:普拉特澤生物-醫(yī)學(xué)整體課題外包

就像“沒有人永遠18歲,但總有人18歲”這句話一樣,我們每年總會遇到剛進入科研領(lǐng)域的新手朋友,所以一些幫助新手快速解決的問題的文章,每年都要更新一遍。

在生物科研這個領(lǐng)域里,很多小伙伴都會接觸到質(zhì)粒這個小東西,而當(dāng)你費盡千辛萬苦后找到這個小東西的圖譜時,你就會發(fā)現(xiàn)圖譜上有很多亂七八糟的箭頭,還有很多英文的序列,比如像什么ORI啊,Amp啊等等,那這些東西究竟是什么意思呢,今天小編就在這里為大家詳細解答一番。


首先要為大家介紹下質(zhì)粒圖譜包含的四大要素。

1.復(fù)制起點:控制著質(zhì)粒的復(fù)制,并決定了質(zhì)粒的宿主和拷貝數(shù)

2.篩選標(biāo)記:多為抗性基因,以便加以檢測篩選

3.多克隆位點:外源基因的插入位點

4.其他元件:如轉(zhuǎn)錄調(diào)控元件、翻譯表達元件和蛋白標(biāo)簽等

以下就用大家常用的pcDNA3.1(+)表達載體作為案例

第一步:了解質(zhì)粒圖譜中的復(fù)制起點

如上圖譜中的ori表示質(zhì)粒的復(fù)制起點。質(zhì)粒的復(fù)制起點決定了質(zhì)粒的宿主及質(zhì)粒的拷貝數(shù)相關(guān)。若圖譜上只有一個ori,表示質(zhì)粒是原核克隆及表達質(zhì)粒。而圖譜上有兩個ori,則表示該質(zhì)粒是穿梭質(zhì)粒,既可以在原核也可以在真核中復(fù)制。

第二步:了解質(zhì)粒圖譜中的篩選標(biāo)記

圖譜中的AmpR、KanR等表示質(zhì)粒載體中的篩選標(biāo)簽,多為抗生素抗性基因,方便后續(xù)通過抗生素篩選陽性克隆。只存在單抗性的質(zhì)粒多為原核克隆載體和原核表達載體。而存在兩種或以上的抗性的多為穿梭質(zhì)粒。

第三步:了解質(zhì)粒圖譜中的多克隆位點

圖譜中的MCS區(qū)或者許多內(nèi)切酶集中的部分,就是質(zhì)粒的多克隆位點。多克隆位點為一系列限制性內(nèi)切酶酶切位點,是外源DNA的插入位點,一般可通過酶切后連接的方式將外源DNA插入質(zhì)粒。多克隆位點一般位于轉(zhuǎn)錄啟動和轉(zhuǎn)錄終止信號之間。

第四步:了解質(zhì)粒圖譜中其它元件

質(zhì)粒載體中除復(fù)制起始位點、篩選標(biāo)記、多克隆位點外,還具有其他一些表達或調(diào)控元件,如轉(zhuǎn)錄調(diào)控元件、翻譯調(diào)控元件和融合表達標(biāo)簽蛋白等。比如:

蛋白純化標(biāo)簽蛋白:His-Tag,GST-tag

蛋白檢測標(biāo)簽蛋白:Myc-Tag,F(xiàn)lag-Tag,HA-Taq

熒光蛋白表達標(biāo)簽:GFP,mCherry

對質(zhì)粒圖譜的介紹差不多就是這些了,相信小伙伴們都已對質(zhì)粒圖譜了然于心了,趕緊找個質(zhì)粒圖譜去看看吧。


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