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DNA pull-dwon實驗介紹【pull dwon外包】

2022-09-27 16:37:57

來源/作者:普拉特澤-生物醫(yī)學整體課題外包平臺

 大家好!今天普拉特澤生物跟大家一起學習一個新的實驗,DNA pull-dwon實驗,實驗介紹由普拉特澤生物分子檢測平臺總結分享,分子檢測平臺專業(yè)承接DNA pull-down實驗外包,為廣大生物科研路上的研究人提供實驗上的幫助。

  DNA Pull down實驗是用脫硫生物素標記特異性DNA探針,脫硫生物素探針可以和偶聯(lián)在磁珠上的鏈霉親和素親和結合。提取物與磁珠-DNA探針孵育,作用蛋白質(zhì)分子可以和DNA探針特異性結合;經(jīng)過洗滌可以將非特異性結合蛋白質(zhì)去除;用 Western Blot或質(zhì)譜對產(chǎn)物進行檢測分析。

        一、實驗流程

         一般來說,該實驗首先,需要針對待研究目的基因的調(diào)控區(qū)域設計并制備特異性探針(以脫硫生物素標記為主流);同時,制備細胞核提取物;將探針和核提取物共同孵育,DNA結合蛋白就會和靶向序列特異性結合;然后,通過親和素磁珠純化蛋白質(zhì)DNA復合物;最后針對獲得的蛋白,使用Western blot驗證或者質(zhì)譜方式鑒定蛋白質(zhì)類型。

       二、 DNA pull-down技術應用

        DNA pull-down以感興趣的DNA序列為探針,尋找與該序列結合的蛋白質(zhì),最常見的應用是尋找某特定基因啟動子區(qū)域的轉(zhuǎn)錄因子。

        a. DNA Pull down WB,用于檢測目標DNA序列與某樣本中的待測蛋白是否存在相互作用;

        b. DNA Pull down MS,用于篩選目標DNA序列與某樣本中的哪些蛋白具有相互作用。

        三、RNA pulldown優(yōu)缺點:

        ① 富集分析低豐度蛋白;

        ② 探針制備簡便,周期短;

        ③ 獲得特異性蛋白與下游蛋白質(zhì)檢測技術兼容;

        缺點:

        ① 長連探針往往存在非特異結合現(xiàn)象;

        ② 反應條件要求無核酸酶;

        ③ 體外實驗,相對體內(nèi)實驗存在一定弊端;

        四、RNA pulldown實驗步驟

        1.探針設計及標記

   2.樣本前處理

   3. Pull down

   4.蛋白質(zhì)檢測-- Western blot

   5.蛋白質(zhì)檢測-- MS

   好啦,DNA pull-down實驗就簡單介紹到這里啦,結尾給大家簡單介紹了一下實驗的框架流程,下期根據(jù)這個流程給大家詳細分享DNA pull-down實驗的詳細步驟,如果您也對DNA pull-down實驗感興趣或有DNA pull-down外包的需求,歡迎選擇咱們普拉特澤生物!下期見~

        




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