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【精品導(dǎo)讀】單細(xì)胞測(cè)序是一種可以為好思路賦能的手段

相信大家對(duì)單細(xì)胞都不陌生，就算沒做過，也肯定聽說過。很多做單細(xì)胞包發(fā)文的公司會(huì)告訴你“現(xiàn)在做單細(xì)胞就只能發(fā)個(gè)五六分了，不像以前好發(fā)”。這是普遍現(xiàn)象，但不是絕對(duì)現(xiàn)象。單細(xì)胞發(fā)文的新手福利期已過，SCI和標(biāo)書的評(píng)委們對(duì)這樣的技術(shù)手段司空見慣，因此逐漸對(duì)研究的深度及研究的價(jià)值提出了更高要求。如果要發(fā)文章，單細(xì)胞是一個(gè)不錯(cuò)的捷徑；但如果要中“國自”，僅有單細(xì)胞，絕不足夠。

請(qǐng)看國家自然科學(xué)基金-醫(yī)學(xué)科學(xué)部對(duì)通訊評(píng)審的評(píng)閱要求——

醫(yī)學(xué)科學(xué)部將科學(xué)研究的“原創(chuàng)性”“真實(shí)可靠性”“科學(xué)意義和價(jià)值”作為項(xiàng)目評(píng)價(jià)的主要原則和標(biāo)準(zhǔn)，遴選出“具有真正創(chuàng)新思想”的研究項(xiàng)目和優(yōu)秀人才，鼓勵(lì)研究人員潛心探究、攻克具有“挑戰(zhàn)性和變革意義的疑難科學(xué)問題”，培育并形成“十年磨一劍”的學(xué)術(shù)氛圍。

那么如何提升單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)的發(fā)文水平，為國自課題的申報(bào)助力呢？

今天小編給大家提供一個(gè)研究案例，來自2022年10月22日，上海復(fù)旦大學(xué)陳曉軍/趙冰合作課題組在《Nature Communications》期刊上發(fā)表的關(guān)于人子宮內(nèi)膜樣癌的起源和病理過程的研究。

該研究團(tuán)隊(duì)通過單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析繪制了人類正常子宮內(nèi)膜向子宮內(nèi)膜癌轉(zhuǎn)變過程中不同細(xì)胞亞群細(xì)胞的動(dòng)態(tài)圖譜。

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論文鏈接：https://doi.org/10.1038/s41467-022-33982-7

子宮內(nèi)膜癌（EC）是繼宮頸癌后第二常見的婦科惡性腫瘤之一，是發(fā)生于子宮內(nèi)膜的一種上皮性惡性腫瘤，子宮內(nèi)膜樣癌（EEC）是EC的主要病理特征。在EEC腫瘤發(fā)生中，子宮內(nèi)膜缺乏孕酮的保護(hù)，長期暴露于雌激素刺激下發(fā)生惡性增殖，正常子宮內(nèi)膜逐漸發(fā)展為非典型子宮內(nèi)膜增生（EEC癌前階段）。

關(guān)于EEC來源和正常子宮內(nèi)膜向EEC演化過程中細(xì)胞亞群動(dòng)態(tài)變化尚不清楚。因此，該研究通過單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析確定EEC的來源及發(fā)生過程中細(xì)胞亞群的動(dòng)態(tài)變化，為子宮內(nèi)膜癌的診斷和治療提供新的方向。

研究結(jié)果

一、EEC很可能來源于子宮內(nèi)膜上皮細(xì)胞而非基質(zhì)細(xì)胞

該研究共收集了99,215個(gè)細(xì)胞，每個(gè)細(xì)胞產(chǎn)生了2317個(gè)檢測(cè)基因的的中位數(shù)，聚類分為7個(gè)細(xì)胞簇。

對(duì)比不同子宮內(nèi)膜病理階段（AEH、EEC）和正常人類子宮內(nèi)膜樣本細(xì)胞比例發(fā)現(xiàn)：來自不同病理階段的子宮內(nèi)膜基質(zhì)纖維細(xì)胞與正常子宮內(nèi)膜表現(xiàn)出高度相似性，而上皮細(xì)胞存在顯著差異，表明EEC很可能來源于子宮內(nèi)膜上皮細(xì)胞而非基質(zhì)細(xì)胞。

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二、無纖毛上皮細(xì)胞亞群的出現(xiàn)是子宮內(nèi)膜癌發(fā)生的關(guān)鍵步驟

通過研究RNA速度分析預(yù)測(cè)細(xì)胞的發(fā)展軌跡發(fā)現(xiàn)無纖毛的腺細(xì)胞到致癌亞群有強(qiáng)烈的方向性流動(dòng)，表明致癌亞群的來源最可能是無纖毛的腺細(xì)胞，充分證明AEH為EEC的前驅(qū)病變。表明獨(dú)特的無纖毛上皮細(xì)胞亞群的出現(xiàn)是子宮內(nèi)膜癌發(fā)生的關(guān)鍵步驟。

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三、LCN2+SAA1/2+上皮細(xì)胞亞群是EEC形成的早期標(biāo)志物

該研究通過對(duì)比子宮內(nèi)膜病變不同階段的免疫熒光染色證實(shí)，EPCAM + /LCN2 +和SAA1/2細(xì)胞出現(xiàn)在AEH和EEC樣本中，但在正常子宮內(nèi)膜中未出現(xiàn)，因此LCN2+/SAA1/2+上皮細(xì)胞亞群是EEC的早期標(biāo)志物。

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四、免疫逃逸機(jī)制在EEC的發(fā)生過程中具有重要作用

對(duì)比三個(gè)病理階段免疫細(xì)胞聚類發(fā)現(xiàn)：EEC中細(xì)胞毒性CD8 T細(xì)胞和初始CD8 T淋巴細(xì)胞的比例顯著降低，而與免疫抑制相關(guān)的FOXP3+CD4 Treg 淋巴細(xì)胞比例增加，表明免疫逃逸機(jī)制在EEC的發(fā)生過程中發(fā)揮著重要作用。

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全文提煉
該研究通過對(duì)正常子宮內(nèi)膜、AEH和EEC進(jìn)行單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)測(cè)序分析，揭示了EEC起源于無纖毛的腺上皮細(xì)胞和LCN2 + SAA1/2+細(xì)胞的出現(xiàn)是子宮內(nèi)膜腫瘤形成的一個(gè)重要標(biāo)志。描繪了內(nèi)膜癌發(fā)生過程中腫瘤微環(huán)境和細(xì)胞亞群的動(dòng)態(tài)變化，根據(jù)CD8淋巴細(xì)胞群比例下降，CD4 Treg細(xì)胞群的比例增加，推測(cè)免疫逃逸與子宮內(nèi)膜癌的發(fā)生密切相關(guān)，為內(nèi)膜癌細(xì)胞起源、早期診斷及臨床治療提供了新的線索方向。

單細(xì)胞測(cè)序指在單個(gè)細(xì)胞水平上進(jìn)行基因組、轉(zhuǎn)錄組或表觀組測(cè)序的技術(shù)，近幾年單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)取得飛速發(fā)展及矚目成果，越來越多的高水平文章橫空出世，在腫瘤、微生物、免疫學(xué)和神經(jīng)科學(xué)等領(lǐng)域正在慢慢得到應(yīng)用。

普拉特澤生物已搭建全新單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序分析平臺(tái)，擁有過硬的實(shí)驗(yàn)技術(shù)團(tuán)隊(duì)和豐富的項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn)可以為廣大科研工作者和臨床工作者提供更為優(yōu)質(zhì)的單細(xì)胞多組學(xué)服務(wù)，包括：單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組，單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組+V(D)免疫組聯(lián)合分析，單細(xì)胞ATAC以及單細(xì)胞ATAC+mRNA聯(lián)合分析。此外我們還提供利用Feature Barcoding的單細(xì)胞表面蛋白檢測(cè)，及單細(xì)胞表面抗原特異性檢測(cè)等服務(wù)。

服務(wù)案例：

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好，本期的精品導(dǎo)讀就到這里

我們下期再見~

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